目前對前列腺炎患者及具有前列腺炎樣症狀者病情的自然轉歸及治療預後還不完全清楚， 雖臨床有一些觀察結果可供參考， 但均不是可靠結論， 尚缺乏良好的循證醫學證據。
急性前列腺炎
急性前列腺炎經積極治療者預後一般良好， 但部分患者的臨床症狀持續存在， 疾病由急性轉為慢性的自然進程還不清楚， 因此臨床至少應該隨訪3個月， 以觀察預後， 指導治療。
慢性前列腺炎
慢性前列腺炎的自然病程和預後轉歸十分不清晰， 尤其是慢性前列腺炎久治不愈的危險因素也仍有待討論。
藥物治療慢性前列腺炎的療效也難以評價， 臨床症狀完全緩解率初步統計在30﹪~40﹪， 餘下的患者則有不同程度的前列腺炎症狀。 長期治療者治癒率可達到50﹪， 症狀改善者可達25﹪。 但仍有20﹪以上的患者治療超過1年仍然沒有任何效果， 患者多數選擇放棄治療， 無奈只能忍受疾病的痛苦。
手術的治癒率很大程度上取決於術者的操作技術， 即使技術精湛的泌尿外科醫師採用經尿道前列腺電切方法切除前列腺， 也只有80﹪左右的患者能夠得到治癒或改善。 1992年一項國外研究發現， 即使將患者的全部盆腔臟器都切除， 其盆腔疼痛症狀仍然可能存在， 因此這些對常規藥物及手術治療無效的前列腺炎原因仍有待深入研究。
