急性細菌性痢疾其典型病變過程為初期的急性卡他性炎、隨後的特徵性假膜性炎和潰瘍形成， 最後癒合。 早期粘液分泌亢進， 粘膜充血、水腫、中性粒細胞和巨噬細胞浸潤。 可見點狀出血。 病變進一步發展粘膜淺表壞死， 在滲出物中有大量纖維素， 後者與壞死組織、炎症細胞和紅細胞及細菌一起形成特徵性的假膜。 假膜首先出現於粘膜皺襞的頂部， 呈糠皮狀， 隨著病變的擴大可融合成片。 假膜一般呈灰白色， 如出血明顯則呈暗紅色， 如受膽色素浸染則呈灰綠色。 大約一周左右， 假膜開始脫落， 形成大小不等，
細菌性痢疾粘膜表面見糠皮樣外觀假膜由纖維素和炎細胞等構成
臨床上由於病變腸管蠕動亢進並有痙攣， 引起陣發性腹痛、腹瀉等症狀。 由於炎症刺激直腸壁內的神經末梢及肛門括約肌， 導致裡急後重和排便次數增多。 與腸道的病變相對應， 最初為稀便混有粘液， 待腸內容物排盡後轉為粘液膿血便， 偶爾排出片狀假膜。 急性菌痢的病程一般1-2周， 經適當治療大多痊癒。 併發症如腸出血、腸穿孔少見， 少數病例可轉為慢性。
