在絕大多數傳染病(如麻疹、白喉、脊髓灰質炎等)已被基本控制的今天， 為什麼菌痢則依然如故， 發病率至今下降不多， 有時還會暴發流行呢？
其原因為：
①痢疾桿菌的種類多、變異性大：菌痢是由痢疾桿菌引起的， 最常見的種類有：福氏、宋內、志賀、舒密次、鮑依德桿菌， 而以上每種桿菌又可分為許多型及亞型， 譬如：福氏(B群)可分為1～6型及X、Y變種等多種亞型。 每一個型的痢疾桿菌是一種抗原， 它們相互之間沒有交叉免疫力。 所以， 這次得了一種， 下次可以得另一種細菌引起的痢疾。 再加上菌型容易變異， 則進一步加深了痢疾桿菌分型的複雜程度，
②容易感染：菌痢是通過糞便經口傳播的， 它的傳染性強。 菌痢病人的1克糞便中， 可含1億多個痢疾桿菌。 它對環境的污染非常廣泛， 如菌痢病人接觸過的食具、傢俱、衣被、書籍、門把手、水龍頭等， 均可檢出痢疾桿菌。 蒼蠅是常見的傳播媒介， 易於污染多種用具及食品。 痢疾桿菌在水中可生存5～9日， 食物中可生存數十日， 在低溫及潮濕地方可生存幾個月。 所以在飲食衛生制度不健全的集體單位、托幼機構極易引起菌痢流行。
③治療不徹底：大多數治療不徹底的病人均是不遵照醫師的醫囑辦事，
