漢唐年間， 氣功在醫務界頗為盛行。 當時的名醫如華佗、葛洪、陶弘景、巢元方、孫思邈等都是精于氣功的大師。 他們在氣功健身的實踐和文獻的整理上都有重大的貢獻。
宋、遼、金、元四朝， 戰爭頻繁， 社會動盪， 百病叢生， 急需解決疾病的治療是當時醫學界面臨的最迫切問題。 所以， 氣功雖已不象漢唐時期那麼盛行， 但並沒有被排斥在醫界正宗之外。 金元時期醫學界四大名醫之一、寒涼派代表人劉完素在他的《素問病機氣宜保命集》中就有氣功養生的記載：“吹噓呼吸， 吐故呐新……此皆修真之要也”。 金元四大家之一的李東垣也認為：“夜半收心靜坐少時，
明至清末， 氣功在醫學界更受重視， 氣功養生的著述也較多。 明代名醫張景岳在《類經》一書裡， 對氣功有正確的評價， 並且涉及了氣功和藥物的長短所在。 他說：“……雖軒歧之教， 初未嘗廢恬淡虛無， 呼吸精氣之說， 然而緩急之宜， 各有所用， 若於無事之時， 因其固有而存之養之， 亦是為卻病延年之助， 此修養之道， 而能及其妙者， 固不可不知也。 至於疾病既成， 營衛既亂， 欲舍醫藥， 而望其可除， 無可複， 則無是理也”。 對氣功的具體做法，
宋代的《聖濟總錄》載有“以意氣攻病法”， 曰：“其有宿患， 但用意並氣， 法之患處， 不過三五日， 必愈。 若四肢有患， 亦可想氣以攻之， 其病隨散。 ”這種療法， 清代醫家稱為“運氣法”。 清代名醫張志聰對“運氣法”深有體驗， 他曾用此法攻除自身的癰毒。
此外， 明清醫家如李士材、龔廷賢、龔居中、李時珍、沈金螯等對氣功療法均有論述， 不勝枚舉。
