由於大部分人缺乏對甲型H1N1流感病毒的免疫力， 而且甲型H1N1流感病毒具有一定的人傳人的能力， 因此， 若防控不力或不當， 則有可能引起流感大流行。 此類病毒一旦引起大流行， 影響程度很難預測：其取決於病毒的毒力、人群的免疫水準、從季節性流感病毒感染獲得抗體的交叉保護作用以及宿主的個體因素。 不排除甲型H1N1流感病毒能通過與人流感病毒重組重配， 成為雜交病毒， 從而引起大流行的可能。
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