肛門部不能靜養， 膿腔不易粘合， 排糞、排尿時， 因括約肌收縮或因炎症刺激肛門括約肌， 使肛門括約肌經常處於痙攣狀態。
肛瘺是一種常見的肛腸疾病， 多發病於青壯年男性， 但其他年齡及女性也可發病。 肛瘺是由於肛腸部位受到感染， 由肛竇炎等炎症引起， 由內而外發病。 在發病初期， 肛周部位可見膿包， 叫做肛周膿腫， 肛周膿腫破潰後， 皮下組織形成纖維化的瘺管， 就是肛瘺。
1、腸腔中的糞便、腸液和氣體繼續進入瘺管， 刺激管壁， 使管壁結締組織增生變厚，
2、內口的存在， 膿腫雖然破潰或已切開引流， 但原發感染源如肛竇炎或肛腺感染依然存在， 腸腔內容物還可從內口繼續進入瘺管；
3、管道多在不同高度穿過肛門括約肌， 括約肌收縮阻礙膿液排出， 以致引流不暢。
4、肛門部不能靜養， 膿腔不易粘合， 排糞、排尿時， 因括約肌收縮或因炎症刺激肛門括約肌， 使肛門括約肌經常處於痙攣狀態；
5、膿腔引流不暢， 或外口縮小， 時閉時潰， 膿液蓄積腔內， 導致膿腫再發並穿破而形成新的支管或瘺道;除此之外， 結核克隆重氏病、潰瘍性結腸炎等都是形成肛瘺的原因。
