肛瘺常有肛周膿腫自行潰破或切開排膿的病史， 此後傷口經久不愈， 成為肛瘺外口。 主要症狀是反復自外口流出少量膿液， 污染內褲；有時膿液刺激肛周皮膚， 有瘙癢感。 若外口暫時封閉， 膿液積存， 局部呈紅腫， 則有脹痛， 封閉的外口可再穿破， 或在附近穿破形成另一新外口， 如此反復發作， 可形成多個外口， 相互溝通。 如瘺管引流通暢， 則局部無疼痛， 僅有輕微發脹不適， 病人常不介意。
常見症狀為以下4點：
1、排膿：排膿是肛瘺的主要早期症狀。 一般來說， 新生成的瘺管排膿較多， 膿汁粘稠， 黃色、味臭；瘺管日久的排膿相對較少，
2、瘙癢：肛門部皮膚由於膿液及其他排出物刺激， 膿液不斷刺激肛周皮膚， 常感覺皮膚瘙癢。 肛周潮濕不適， 皮膚變色、表皮脫落， 纖維組織增生和增厚， 有時形成濕疹。
3、疼痛：瘺管通暢無炎症時， 一般無疼痛， 只有肛門局部略有腫脹感， 行走時可加重， 若外口封閉， 瘺管存積膿液， 或糞便進入瘺管， 則會疼痛加重或排糞時疼痛加重， 而內盲瘺則常感直腸下部和肛門部灼熱不適， 排糞時疼痛加重。
4、硬結或瘢痕：由於瘺管壁及瘺口的反復刺激，
肛瘺一旦形成， 就不可能自然癒合， 必須要手術治療介入才能根治。 對於肛瘺的治療， 傳統的往往痛苦很大， 且治療不徹底， 極易復發， 積極的診斷和治療最關鍵！
