（1）新生兒期肝腎均未發育成熟， 肝酶的分泌不足或缺乏， 腎清除功能較差， 因此新生兒感染時應避免使用毒性大的抗菌藥物， 包括主要經腎排泄的氨基糖苷類、萬古黴素、去甲萬古黴素等， 以及主要經肝代謝的氯黴素。 確有應用指征時， 必須進行血藥濃度監測， 據此調整給藥方案， 個體化給藥， 以確保治療安全有效。 不能進行血藥濃度監測者， 不可選用上述藥物。
（2）新生兒期避免應用或禁用可能發生嚴重不良反應的抗菌藥物。 可影響新生兒生長發育的四環素類、喹諾酮類（沙星類）禁用，
（3）新生兒期由於腎功能尚不完善， 主要經腎排出的青黴素類、頭孢菌素類等β-內醯胺類藥物需減量應用， 以防止藥物在體內蓄積導致嚴重中樞神經系統毒性反應的發生。
（4）新生兒的體重和組織器官日益成熟， 抗菌藥物在新生兒的藥代動力學亦隨日齡增長而變化， 因此使用抗菌藥物時應按日齡調整給藥方案。
小兒患者在應用抗菌藥物時應注意以下幾點：
（1）氨基糖苷類抗生素：該類藥物有明顯耳、腎毒性， 小兒患者應儘量避免使用。 臨床有明確應用指征又無其他毒性的抗菌藥物可供選用時， 方可選用該類藥物， 並在治療過程中嚴密觀察不良反應。
（2）萬古黴素和去甲萬古黴素：該類藥也有一定的耳腎毒性， 小兒患者僅在有明確指征時方可選用。 在治療過程中應嚴密觀察不良反應， 並應進行血藥濃度監測， 個體化給藥。
（3）四環素類抗生素：可導致牙齒著色及牙釉質發育不良。 不可用於8歲以下小兒患者。
（4）喹諾酮類（沙星類）：由於對骨骼發育可能產生的不良影響， 該類藥物避免用於18歲以下的未成年人。
