肝炎患者進行肝移植手術後， 可能出現腹腔內出血、血管栓塞、膽汁滲漏、排斥反應、感染、膽管狹窄等多種併發症， 應及時進行處理， 縮短新肝適應時間。
1、腹腔內出血：手術後新肝的功能正逐漸恢復中， 所以術後早期仍有再出血的可能， 可進行輸血等保守治療， 必要時需重回手術室止血。
2、血管栓塞：手術中需吻合的肝動脈、肝靜脈、門靜脈等血管有血栓阻塞的可能性， 通常需要藥物治療或開刀清除血栓。
3、膽汁滲漏：膽汁可能由膽管吻合處或由肝臟切面滲漏， 可根據具體情況採取密切持續觀察、放置引流管或手術處理。
4、排斥反應：肝臟移植後仍有近兩成病患發生排斥反應， 依病情給予抗排斥治療並調整免疫抑制劑的劑量。
5、感染：免疫抑制劑的使用會降低抵抗力， 較易遭受感染， 應密切觀察病人是否有任何感染跡象， 必要時給予適當的藥物預防或控制感染。
6、膽管狹窄：移植手術後， 膽管吻合處可能有狹窄情形， 導致膽汁引流阻塞， 可視情況於膽管內放置T型引流管或氣球導管擴張， 若症狀無改善， 視情況做膽管重建手術。
