急性甲型肝炎與乙型肝炎、丙型肝炎鑒別不難。 甲型肝炎一般呈流行或暴發， 以學齡前兒童及青壯年多見， 起病急， 常有發熱， 病前有可疑不潔飲食史， 而乙、丙型肝炎多為散發， 以成人為主， 多無發熱。
甲型肝炎與戊型肝炎有時不易鑒別， 戊型肝炎亦呈流行或暴發， 亦有不潔飲食史， 但發病年齡以15～39歲年齡組為多， 且淤膽型的比例較高， 而鑒別診斷的主要依據是病毒特異性免疫學檢測。
急性甲型肝炎並須與EBV感染相鑒別， 後者發熱時間較長， 常有咽峽炎、淋巴結腫大、異型淋巴細胞增多、噬異凝集試驗陽性、抗-HAVIgM陽性等。
此外， 急性重型甲型肝炎須與中毒性及藥物性肝炎相鑒別， 主要根據病前有無誤食毒物或用藥史。
區別甲肝看這2個時期
黃疸期
起病急， 有畏寒、發熱、全身乏力、食欲不振、厭油、噁心、嘔吐、腹痛、肝區痛、腹瀉、鳥色逐漸加深， 至本期末程濃茶狀。 少數病例以發熱、頭痛、上呼吸道症狀等為主要表現。 本期持續1-21日，
自覺症狀可有所好轉， 發熱減退， 但尿色繼續加深， 鞏膜、皮膚出現黃染， 約于2周內達高峰。 可有大便顏色變淺、皮膚騷癢、心動過緩等梗阻性黃疸表現。 肝腫大至肋下1-3cm， 有充實感， 有壓痛及叩擊痛。 部分病例有輕度脾腫大。 本期持續2-6周。
恢復期
黃疸逐漸退， 症狀減輕以至消失， 肝、脾回縮， 肝功能逐漸恢復正常。 本期持續2周至4個月， 平均個月。 色繼續加深， 鞏膜、皮膚出現黃染， 約于2周內達高峰。 可有大便顏色變淺、皮膚騷癢、心動過緩等梗阻性黃疸表現。 肝腫大至肋下1-3cm， 有充實感， 有壓痛及叩擊痛。 部分病例有輕度脾腫大。 本期持續2-6周。
