如果扁平足患者進行非手術治療失敗， 還可根據病變類型選擇相應手術治療， 但需要注意不同時期的扁平足患者其手術方式也不同。
1期患者
手術切除發炎的腱鞘和腱周組織， 可以減輕症狀。 但此手術並不能改變足部的其它異常， 因此長期效果並不好， 目前已很少單獨使用。 肌腱炎致使肌腱退變切除病變的肌腱後， 可以直接縫合或用屈趾長肌腱加強脛後肌腱。
2期患者
2期患者治療的主要目的是加強脛後肌腱、糾正跟骨外翻合足的外展、穩定足的內側柱、保留距下關節的活動。 由於足的畸形是可複性的，
對於內側柱不穩定者， 需要行距舟、舟楔或蹠楔關節融合；
脛後肌腱功能不全者， 可以使用屈趾長肌腱或屈拇長肌腱移位重建脛後肌腱， 但單純脛後肌腱重建手術效果並不滿意， 常需要同時行跟骨內移截骨， 達到雙重肌腱移位的效果。
近些年來， 已有應用距下關節阻滯術治療2期成人獲得性平足症的報導， 此手術使用內植物植入跗骨竇， 使距下關節仍有部分的活動。 根據需要以後還可取出內植物， 完全恢復關節活動。
3期患者
處於3期病變的患者， 其足部的畸形已固定， 需要進行距下關節融合或結合距舟關節融合， 甚至三關節融合， 以糾正畸形、穩定關節。
4期患者
處於4期病變的患者可能需要行三關節融合、四關節融合或人工關節置換加距下關節融合。
