腦損傷的部位與其出現相應的功能障礙是密切相關的。 腦癱患兒的運動障礙是由於腦的某個部位存在病變， 這種病變主要發生於大腦、小腦及基底神經核。 發生於脊髓的病變不屬於腦癱的範疇。 根據腦損害的部位不同， 大體上可分為錐體系、錐體外系和小腦系三大類。
錐體系
錐體系是大腦頂葉中央溝前存在的運動區皮質錐體細胞發出神經纖維， 通過內囊， 再經腦幹及延髓， 到達脊髓前角細胞所形成的。 脊髓前角細胞的神經纖維與肌肉的運動單位相連接， 形成神經肌肉運動單位， 支配肌肉運動。
錐體外系
除錐體系以外的中樞性神經通路統稱為錐體外系。 錐體外系的功能主要參與自動運動及節律性運動等無意識運動， 以及四肢協同運動的控制及姿勢保持的調節。 錐體外系受損則安靜時四肢及軀幹的姿勢的穩定性， 以及隨意運動時的協調性出現異常。
小腦系
嚴格來講， 小腦也屬錐體外系， 但其也有著自己的獨立性。 小腦對精細隨意運動進行即時控制。 小腦損害則引起運動共濟失調、協調運動障礙、協同運動障礙及運動測距障礙等。
腦癱主要是大腦損傷所致的運動癱瘓，
純屬小腦性癱瘓少見。
實際上，
小腦損害所致的異常常與大腦皮層或基底節性運動異常相併發。
