所有的手術都伴有感染和血栓形成的危險， 肥胖者更容易併發不良反應， 尤其是有早期糖尿病和心臟病症狀的患者。 美國2004年的政府報告估計減肥手術的死亡率大約為0.19%。 年齡大， 高血壓的肥胖者死亡率會更高一些， 但是減肥手術成功後會使嚴重肥胖患者患心臟疾病患病率降低50%， 而且研究還顯示：實施手術者比條件相同單位實行手術者存活時間更長。 因此， 雖然手術有風險， 但它也挽救生命。
出於最大限度降低手術風向的考慮， 醫生會要求患者做詳盡的術前準備以期術前發現患者存在的問題。
手術期待減肥手術和其他手術一樣， 需要術後恢復期。 術後恢復的時間因人而異， 但至少需要一個星期， 通常是3-4個星期。
新的手術技術使術後恢復時間減少。 當今的減肥手術都是微創的。 在美國一些先進的醫療中心， 減肥手術甚至可以在門診完成。
大多數肥胖者術後一個月之內每天會減少大約一磅的體重， 一年之後會減少多餘體重的50%-75%。 但即使到這個時候， 這個過程並沒於停止。 患者會因為營養不良出現相關部兩反應， 比如貧血， 骨質疏鬆，
問自己的問題如果你正在考慮手術減肥， 請捫心自問一下的一些問題（來自美國糖尿病， 消化和腎臟疾病協會）， 如果你所有的回答都是肯定的， 那麼立即聯繫初診醫生和保險公司。
（1）是否所與非手術方法都不能使體重減輕？
（2）是否認真瞭解手術過程和治療效果？
（3）手術是否是為了改善身體健看？
（4）是否瞭解術後生活會發生怎樣攻的改變（比如必須很慢的咀嚼食物， 必須少量進食）？
（5）是否瞭解手術的嚴重併發症， 飲食限制和可能存在的手術失敗？
（6）能否堅持終身隨訪和補充維生素及礦物質
