流行性斑疹傷寒的病理變化的特點是增生性、血栓性、壞死性血管炎及血管周圍炎性細胞浸潤所形成的斑疹傷寒結節。 這種增生性血栓性壞死性血管炎可分佈全身各組織器官。 多見於皮膚、心肌、中樞神經系統。 中樞神經系統以大腦皮質、延髓、基底節的損害最重， 橋腦、脊髓次之。 腦膜可呈急性漿液性炎症。 肺可有間質性炎症和支氣管肺炎。 肝臟匯管區有嗜鹼性單核細胞浸潤， 肝細胞有不同程度的脂肪變性及灶性壞死與單核細胞浸潤。 腎臟主要呈間質性炎性病變。 腎上腺可有出血、水腫和實質細胞退行性變，
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