唐祖宣教授的學術思想是法于古籍精華， 並基於此而創新， 總體概括為注重陽氣、因瘀致病、因病致瘀、痰瘀互結四個方面。
注重陽氣
“天尊地卑， 乾坤定矣。 卑高以陳， 貴賤位矣。 ”此言意指兩個重要中醫基本理論， 即陽主陰從， 陰平陽秘。 陽主陰從指的是在陰陽的相互關係中， 陽主導， 陰從屬。 陰平陽秘中的秘， 是封藏之意。
因瘀致病
瘀阻於心， 可見心悸、胸悶心痛、口唇指甲青紫；瘀阻於肺， 可見胸痛、咳血；瘀阻胃腸， 可見嘔血， 大便色黑如漆；瘀阻於肝， 可見脅痛痞塊；瘀血攻心， 可致發狂；瘀阻胞宮， 可見少腹疼痛、月經不調、痛經、閉經、經色紫色成塊，
因病致瘀
瘀血形成之後， 不僅失去正常血液的濡養作用， 而且反過來影響全身或局部血液的運行， 產生疼痛、出血、經脈瘀澀不通， 臟腑發生癥積， 而導致的這些疾病又可以產生新的瘀血， 以及“瘀血不去， 新血不生”等後果。
痰瘀互結
痰飲是機體水液代謝障礙所形成的病理產物， 黏稠者為痰， 清稀者為飲。 《金匱要略》首創痰飲病名， 分為痰飲、懸飲、溢飲、支飲四類。 痰飲與瘀血在臨床上互為因果或者共同為病。 津血同源， 由水穀精微所化生， 流行於脈內者為血， 布微於經脈之外者為液， 賴臟腑的氣化作用， 出入于脈管內外，
