前列腺炎傳染的因素還會有神經內分泌的因素：那麼患者前列腺痛會容易使心率和血壓發生波動， 表明可能與自主神經反應有關。 其疼痛具有內臟器官疼痛的特點， 前列腺、尿道的局部病理刺激， 通過前列腺的傳入神經觸發脊髓反射， 啟動腰、骶髓的星形膠質細胞， 神經衝動通過生殖股神經和髂腹股溝神經傳出衝動， 交感神經末梢釋放去甲腎上腺素、前列腺素、降鈣素基因相關肽、P物質等， 引起膀胱尿道功能紊亂， 並導致會陰、盆底肌肉異常活動， 在前列腺以外的相應區域出現持續的疼痛和牽涉痛。
排尿功能障礙：某些因素引起尿道括約肌過度收縮， 導致膀胱出口梗阻與殘餘尿形成， 造成尿液反流入前列腺， 不僅可將病原體帶入前列腺， 也可直接刺激前列腺， 誘發無菌的“化學性前列腺炎”， 引起排尿異常和骨盆區域疼痛等。
精神心理因素：研究表明， 經久不愈的前列腺炎患者中一半以上存在明顯的精神心理因素和人格特徵改變。 如：焦慮、壓抑、疑病症、癔病， 甚至自殺傾向。 這些精神、心理因素的變化可引起植物神經功能紊亂， 造成後尿道神經肌肉功能失調， 導致骨盆區域疼痛及排尿功能失調;或引起下丘腦-垂體-性腺軸功能變化而影響性功能， 進一步加重症狀， 消除精神緊張可使症狀緩解或痊癒。 但目前還不清楚精神心理改變是其直接原因，
