為了提高種子的品質， 防治種子病害， 打破種子休眠， 促進種子萌芽和幼苗健壯成長， 中藥材種子在播種前要進行處理。 其主要常規處理方法歸納如下：
一、選種：選取顆粒飽滿、發育完善、大小均勻一致、不攜帶病蟲卵細菌、生命力強的種子。 數量小時可手工選種， 數量大時可用水選或風選。
二、曬種：播種前曬種能促進某藥材種子的生理後熟， 促進種子內部新陳代謝， 增強種子成活力， 提高發芽率， 並起到殺菌消毒的作用。 曬種一般選晴朗天氣曬2-3天。 在水泥地上曬種時， 注意不能攤工巧匠得太溥， 以防燙傷種子，
三、浸種：用冷水或40度左右溫水直接浸種或冷、熱水變溫交潛浸種24小時， 可使種皮老化、透性增強， 並能殺死種子內外所帶病菌， 防止病害傳播， 促進種子快速、整齊地萌發。 若浸種時採用一些化學物質直接進行種子處理， 可得到更好效果。
1、根據種特性， 選擇適宜的化學藥劑和適當的濃度處理種子。 如黨參種子在0.1%小蘇打、0.1%溴化鉀深液中浸30 秒， 撈起立即播種， 一般發芽可提早10~12天， 發芽率高10%左右。
2、用生長激素處理。 常用激素有吲哚乙酸、赤黴素等。 如黨參種子用0.005%的赤黴素深液浸6小時， 發芽率提高11.5%。
3、 在水中加入微量元素浸種。 常用的微量元素有硼、鋅、錳、銅、鉬等。 如桔梗種子用0.3-0.5%高錳酸鉀溶液浸一天，
4、 擦傷和破殼處理：有些藥材種子皮堅硬， 富含蠟質， 不透水， 影響種子的萌發。 採用人工破殼、搓擦等方法操作種皮， 可增強透性， 促進萌發。 如杜仲可採用剪破翅果， 取出種仁直接播種， 黃芪、穿心連的種子種皮有蠟質， 可先用細沙磨擦， 再用溫水浸種， 可顯著提高發芽率。
5、 層積處理：即一層濕砂， 一薄層種子， 再蓋一層濕砂， 再撒一薄層種子， 如此重複堆積處理的方法。 此法可打破種子休眠， 促進後熟和萌發。 如芍藥、黃連、銀杏種子常用層積處理來促進萌芽。
6、 拌種：一般用藥劑拌種， 可起到殺菌消毒、促進生長吸收的作用。 如每500克種子加3-4克50%多菌靈拌種， 可殺死種子表面及土壤中病菌，
除以上常用的方法外， 還可用射線、超聲波處理藥材種子， 有促進發芽、生長旺盛， 早熟增產等作用。
