目前認為系統性紅斑狼瘡（SLE）患者發生骨質疏鬆可能的血管機制是， 動靜脈微血管炎和微血管痙攣導致微循環障礙， 使骨骼血供中斷， 骨礦物質丟失， 骨小梁變細。 當受到壓力影響時， 遂發生骨萎縮、骨質疏鬆。
SLE患者易發生骨質疏鬆的危險因素是多方面的， 包括疾病活動、治療藥物及生活方式（吸煙）等。 糖皮質激素是目前已知的藥物中對骨質疏鬆的影響最突出和最廣泛的。 糖皮質激素對骨骼的副作用在SLE治療開始3個月即迅速出現；所有接受每日超過7.5毫克潑尼松治療的患者， 均出現骨量丟失增加。
除了糖皮質激素外， 非激素免疫抑制劑的使用也是導致患者骨質疏鬆的危險因素， 如研究發現硫唑嘌呤、甲氨蝶呤可導致患者發生骨質疏鬆的病理改變。
長期應用肝素、環孢素A治療的SLE患者也可以發生骨質疏鬆。 但總的來說， 到目前為止免疫抑制劑對骨質疏鬆的影響遠沒有糖皮質激素的影響大， 機制也不完全清楚， 各項研究資料結果也不一致。 鈣和維生素D缺乏也是SLE患者骨質疏鬆的重要危險因素。
