疾病的發生與發展是正氣與邪氣鬥爭的過程。 正氣充沛， 則人體有抗病能力， 疾病就會減少或不發生；若正氣不足， 疾病就會發生和發展。 因此， 治療的關鍵就是要改變正邪雙方力量的對比， 扶助正氣， 祛除邪氣， 使疾病向痊癒的方向轉化。
扶正：就是使用扶正的藥物或其它方法， 以增加體質， 提高抗病能力， 以達到戰勝疾病、恢復健康的目的。 適用於正氣虛為主的疾病， 是《內經》“虛則補之”的運用。 臨床上根據不同的病情， 有益氣、養血、滋陰、壯陽等不同的方法。
祛邪：就是祛除體內的邪氣， 達到邪去正複的目的。
臨床運用扶正祛邪這一原則， 要認真細緻地觀察邪正消長的盛衰情況， 根據正邪雙方在疾病過程中所處的不同地位， 分清主次、先後、靈活地運用。
單純扶正僅適用於正虛為主者；單純祛邪僅適用于邪盛為主者；先祛邪後扶正則適用于邪盛而正不甚虛者；先扶正後祛邪則適用於正虛而邪不甚者；扶正與祛邪並用則適用於正虛邪實者， 即所謂“攻補兼施”， 當然亦需分清是虛多實少， 還是實多虛少。 若虛多則扶正為主， 兼以祛邪， 實多則又以祛邪為主， 兼以扶正。
總之， 要以“扶正不留邪， 祛邪不傷正”為原則。
