1、控制病毒載量
在應用抗病毒藥物時， 如果HIV持續高水準複製， 則可能出現耐藥。 HIV病毒對所有的治療藥物都可能產生耐藥， 但如果幾種藥物聯合應用， 會延遲耐藥的發生， 可能在相對較長的時間內都不會出現耐藥。 原因是多藥聯合應用可以對HIV發揮更大的抑制作用。 HIV病毒對一種藥物容易產生耐藥， 但對聯合方案中所有的抗病毒藥物都發生耐藥則較為困難。
開始治療後， 病毒量下降到50拷貝以下的患者比病毒載量不能下降到這一水準的患者， 發生耐藥的危險性較小。
開始治療後， 病毒載量的最小值稱為最低點， 可以預示未來能否發生病毒量反跳的可能性。 最低點越低， 發生反跳的可能性越小， 因此發生耐藥的危險性越低。
2、改變抗病毒藥物時需要注意的事項
將一種新的藥物加入到原有聯合治療組合中， 並不能使病毒得到完全抑制， 因為一種抗病毒藥物很難抑制病毒的複製。 因此， 如果原治療方案不理想， 想改變治療方案時， 應當盡可能多（全部替換最為理想）的替換原有的藥物， 以便於使新的治療方案有效發揮作用。
替換藥物需要做相關檢測， 以確定您是否對一些特殊藥物耐藥。
如果病毒得到較好抑制， 是由於藥物的副作用而更換藥物， 並不說明有相同的耐藥發生率。 這時， 醫生會只更換一種藥物。
3、早期更換治療方案
不同的抗病毒藥物， 發生耐藥的速度不同。 HIV只需要一次突變就會對3TC（拉米夫定）、依非韋倫和奈韋拉平產生完全耐藥。 單次突變較為普遍， 在病毒載量很低的狀況下也可以很容易發生。
HIV對其他藥物的完全耐藥需要特定組合的多次突變才會發生， 需要的時間較長。 只有在繼續服用原有藥物、HIV不斷複製的情況下， 耐藥才會發生。 換句話說， 在病毒載量發生反跳的情況下， 如果不改變原有的治療藥物， 發生耐藥的危險性較大。 病毒載量反跳的程度越高，
4、按照處方服用抗病毒藥物
按照醫生的處方服用抗病毒藥物極為重要。 必須按時按量服用， 按照要求食用該吃的食物。 按照規定服藥的程度稱為依從性。
漏服藥物或延遲服藥及沒有按照規定劑量服用， 會降低體內藥物的有效濃度， 降低聯合治療的抗病毒療效。 被抑制的病毒又開始複製， 增加了耐藥病毒株出現的危險性。
每月僅有幾次漏服藥物也足以導致治療失敗， 因此在開始抗病毒治療之前必須做好準備， 在治療期間必須要保證藥物的供給。 治療中心、當地的AIDS組織、朋友和家人以及其他HIV感染者都能幫助您提高依從性。
選擇一個你能接受的治療組合， 養成定時服藥的習慣， 找到能避免漏服藥物的方法。 但是隨著服藥時間的延長， 會發生一些事情， 可能有助於提高你的依從性， 也可能降低你的依從性。 如果你有這方面的擔心或者感到治療不適合你， 需要向治療中心的醫生講明。 不要在沒有向醫生諮詢就貿然停藥， 這樣可以引發耐藥病毒株的出現。
5、交叉耐藥
單次或多次突變會使HIV對不同的抗病毒藥物發生耐藥， 一旦發生對一種藥物的耐藥， 可能對其他未曾使用的藥物也發生耐藥， 這稱現象稱為交叉耐藥。
交叉耐藥可以影響現有抗病毒藥物的應用範圍。 對一種核苷酸類似物產生耐藥， 會影響同一種類的其他藥物的選擇。
新型的抗病毒藥物正處於研製階段， 但也會受交叉耐藥的影響。
