直腸炎起病多數緩慢， 少數可急性起病， 病程呈慢性， 遷延數年至十餘年， 常有發作期與緩解期交替或持續性逐漸加重， 偶呈急性暴發， 直腸炎如得不到及時治療是有癌變的危險的， 因此做好及時的檢查治療是很關鍵的。
直腸炎的危害不小， 直腸炎如不及時治療會轉為直腸癌， 前期也許感覺不明顯， 但免疫力會明顯下降， 有婦科或男性前列腺方面的問題會隨後發生， 此時一般伴隨結腸炎， 人體50%的免疫都在結腸， 所以會有很多性的問題出現。 到後期有所感覺時， 一般為時已晚。
直腸炎可引起的病變：
腸狹窄：多發生在病變廣泛、病程持續長達5-25年以上的病例， 其部位直腸， 臨床上一般無症狀， 嚴重時可引起腸阻塞， 在本病出現腸狹窄時， 要警惕腫瘤， 鑒別良性惡性;
肛管炎：這是本病的一個併發症， 經常與直腸炎並稱為肛管直腸炎， 肛管炎久拖不治亦有癌變危險;
腸息肉和結腸癌：直腸炎超過五年， 腸道潰瘍面在炎症的長期刺激下容易異常增生， 引發腸息肉， 一釐米以上腸息肉癌變率極高;
便血：便血是本病的主要臨床表現之一， 便血的多少也是衡量病情輕重的指標。 長期慢性出血可引起缺鐵性貧血;
肛竇炎：直腸炎不及時治療， 可併發肛竇炎等肛腸病， 並有繼發肛周膿腫的危險。
直腸炎忌患者麻痹大意， 誤診誤治、輕信偏方、不接受正規的治療，
