抗甲狀腺藥物治療中最嚴重的副作用是粒細胞缺乏症, 由於粒細胞過少全身抵抗力顯著下降, 繼而導致全身嚴重的感染, 對生命的威脅極大。 因此, 在用藥期間應注意有無粒細胞缺乏症的發生, 如果及時發現, 治癒的機會還比較多。 粒細胞缺乏症發生多在用藥1~3個月期間, 但也可見於用藥後的任何時間。 因此, 在用藥1~3月期間應特別警惕。
粒細胞缺乏症發病有兩種方式, 一種是突然發生, 一般不能預防。 另一種是逐漸發生, 一般先有白細胞減少, 如果繼續用藥, 可以轉變成粒細胞缺乏症。 對後一種發病方式,
粒細胞缺乏症一旦發生, 應立即停用抗甲狀腺藥物, 並送醫院進行搶救。 因病人抵抗力太弱, 應在無菌隔離的病房搶救, 給予大量的糖皮質激素和抗生素治療。 治癒後病人不能再用抗甲狀腺藥物治療甲亢。