引起睡眠呼吸暫停綜合症的原因很多， 有全身性的疾病， 如肥胖、糖尿病、甲狀腺功能低下、肢端肥大症等內分泌系統及神經系統疾病。 此病也能由咽部窄小或阻力增高引起， 如鼻中隔偏曲， 鼻息肉， 扁桃體肥大， 咽部鬆弛， 懸雍垂過長。 舌體肥大， 舌根部腫瘤、舌尾碼， 頜面部發育畸形， 如小頜畸形等。 小兒多由於扁桃體肥大及腺樣體肥大 。
醫學研究證實， 打呼嚕發生的主要原因為鼻和鼻咽、口咽和軟齶及舌根三處發生狹窄、阻塞， 再加上睡眠時咽部軟自製鬆弛、舌根後墜等導致氣流不能自由通過咽部的氣道，
人在睡眠時全身放鬆， 如果鼻咽喉這三個部位有阻塞， 氣流衝擊狹窄的部位， 引起共鳴腔的振動而發出不同程度的響聲。 氣道阻塞越重呼嚕聲就越響， 當阻塞的程度較重時， 就會出現吸氣困難乃至呼吸停止， 繼而缺氧和二氧化碳瀦溜， 血液內為低氧血症和高碳酸血症， 刺激中樞發出指令， 呼吸肌強烈運動， 將肺內的氣體排出， 然後深吸一口氣， 這就形成阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征。 由於體內缺氧和二氧化碳瀦溜， 全身各個部位都會受到不同程度的損害， 尤其是心血管系統和中樞神經系統， 表現為心率失常， 心肌受損， 高血壓， 白天精神萎靡不振， 無精打采，
