目前真正具有較好抗病毒療效的藥物屈指可數。 當今國際醫學界公認的抗乙肝病毒的藥物有a干擾素、核苷類似物。
a干擾素
主要針對血清HBeAg陽性、ALT升高正常值2倍以上的慢性乙肝患者。 HBeAg陰性及HBV攜帶者不宜使用干擾素。 干擾素抗乙肝病毒的主要機理為誘導感染細胞產生抗病毒蛋白， 並能使正常細胞形成抗病毒狀態， 同時刺激肝細胞膜表達HLAI類抗原遞呈病毒抗原， 啟動CTL清除病毒。 20-40%的患者干擾素治療有效。
核苷類似物
代表性藥物有拉米夫定、阿德福韋， 適應症是血清ALT明顯升高、HBV-DNA陽性病人， 不管其HBeAg是陽性還是陰性均可以使用。
此外， 抗病毒藥物都有一定的不良反應， 有的患者會出現發熱、頭痛、禿髮、抑鬱、白細胞下降、食欲下降等， 所以在應用抗病毒藥物進行治療的過程當中， 一定要按醫生要求定期到醫院檢查肝功能， 密切監測可能發生的不良反應， 便於及時發現和處理， 以免導致嚴重後果。
例如應用干擾素的病人應定期進行血常規的檢查， 以防止出現嚴重的骨髓抑制，
有的病人因為害怕上醫院就診， 自行在藥店買藥“自治”， 以為可暫時代替正在服用的抗病毒藥物， 這種做法也是錯誤的。 對於乙肝病人而言， 求助於正規醫院專科醫生才是就診的“正道”。
醫生會通過各種必要的檢查瞭解肝臟情況， 針對不同病情、不同階段， 採用不同的綜合治療措施。 此外， 在正規醫院專科醫生處就診還能避免誤用假冒偽劣的抗病毒藥物。
