免疫組織化學染色法也是組織病理學檢查灰指甲的一種方式， 該方法能夠清楚的觀察到甲組織是腐生菌的污染還是病原菌的侵襲。 在灰指甲的領域裡， 採用免疫組化的方法來檢查標本可以針對特異的單克隆抗體獲得肯定的診斷。 通過免疫組化法， 可以針對不同真菌特異性抗體的測定也證實了混合感染確實存在。
1.免疫組織化學染色法的操作方式
免疫組織化學法首先將甲標本浸泡于10%吐溫40水溶液中， 軟化組織後用石蠟包裹切片， 然後用直接免疫螢光、免疫過氧化物酶或親和生物素複合無方法，
2.可以鑒定的菌種
特異的單克隆抗體包括抗毛癬菌、抗白色念珠菌、抗曲黴菌的單抗， 目前可以鑒定的菌種還有包括念珠菌屬的白色念珠菌、副熱帶念珠菌， 克柔念珠菌、短帚黴屬和鐮刀菌屬等。
3.免疫組織化學染色法的優勢和缺點
免疫組織化學法與培養法結合能更清楚地瞭解， 甲組織內真菌是腐生菌的污染還是病原菌的侵襲生長， 而且還可證實混合感染的存在。 其缺點是標本易從玻片上脫落， 真菌菌絲很容易失去正常的形態， 因為單抗種類有限， 不可能鑒定所有的菌種。
