生長遲緩的原因多種多樣, 有的系自然過程, 有的屬遺傳因素, 有的則屬疾病, 其中80%~90%的生長遲緩兒童屬於正常的生長變異, 如家族性矮身材、體質性發育延遲以及低出生體重性矮小, 這些與先天遺傳因素或宮內的發育不良有關, 其生長速度基本正常, 也不需要特殊治療。
對於這樣的孩子, 家長仍應創造良好的後天外部條件, 促進生長潛力最大限度地發揮。
另外一些原因則是屬於病態的, 如染色體異常(唐氏綜合征、特納綜合征)、代謝性疾病、骨骼疾病(骨軟骨發育不全)、慢性疾病、慢性營養不良性疾病、內分泌疾病(如生長激素缺乏症、甲狀腺功能低下症)等引起的生長遲緩,