乙肝病毒攜帶者中約三分之一有反復肝損害， 表現為活動性的乙型肝炎或者肝硬化。 具體分類如下：
按病程長短分類
乙肝可分為急性乙型肝炎和慢性乙型肝炎， 判斷是急性還是慢性乙型肝炎在臨床診治中十分重要， 二者的治療原則不同， 預後也有很大差異， 有時為了區別是急慢性肝炎， 往往通過肝穿病理檢查來判定。
1）急性乙型肝炎是一種自限性疾病， 常常不需要抗病毒治療， 患者血液中HBsAg持續時間低於6個月， 6個月內乙型肝炎病毒被機體免疫系統清除， HBsAg陰轉， 可遺留感染過HBV的血清學標誌：HBe、抗HBe及抗HBS三個抗體陽性，
2）慢性乙型肝炎如一言以蔽之就是HBV存在於機體內超過6個月。
按病情輕重分類
按病情輕重分類可分為乙肝攜帶者、活動性乙型肝炎、重型肝炎、肝炎肝硬化。
1）乙肝攜帶者分慢性HBV-DNA攜帶者（大三陽， DNA定量高水準但肝功正常處於免疫耐受狀態的患者）、非活動性HBsAg攜帶者（小三陽， HBV-DNA低於檢測下限， 肝功正常）。
2）活動性乙型肝炎又分為e抗原陽性的慢性乙型肝炎和e抗原陽性的慢性乙型肝炎。
3）肝炎肝硬化又分為代償期肝硬化和失代償期肝硬化。
4）重型肝炎又可分為急性重型、亞急性重型和慢性重型肝炎。
按有無出現黃疸（即按症狀特點）
可分為黃疸型和無黃疸型， 該分型多針對於急性乙型肝炎， 即急性黃疸型乙肝和急性無黃疸型乙肝。
