強直性脊柱炎的病因尚未完全明確, 目前認為與下列因素有一定關係:
基因因素。 本病發病與遺傳因素有密切關係, 強直性脊柱炎的HLA-B27陽性率高達90%~96%, 家族遺傳陽性率達23.7%, 類風濕者其家族的發病率為正常人的2~10倍, 而強直性脊柱炎家族發病率為正常人的30倍。
感染因素。 泌尿生殖系感染是引起本病的重要因素之一, 盆腔感染經淋巴途徑播散到骶髂關節再到脊柱, 還可擴散到大循環而產生全身症狀及周圍關節、肌腱和眼色素膜的病變。
內分泌、代謝障礙和變態反應等也是本病的誘發因素。