造成我們免疫力低下的重要原因還有妨礙線粒體活動的藥物。 我常年研究導致線粒體呼吸受阻的主要原因， 在此過程中證實了“抗生素會阻止線粒體基因功能發揮”這一事實。
抗生素在醫院裡被頻繁用於處方藥， 它對治療由細菌造成的感染十分有效， 沒有它， 現代人類幾乎無法維持健康的生活。 所以我看其蹤跡在短期內不會消失。 抗生素主要是真菌類產生的有機化學物質， 也有的是合成物質。 它作用於造成細胞感染的微生物（病菌）， 阻礙其繁殖， 再將其殺死。 而線粒體原本是一種在18 億年前寄生於真核生物當中的細菌，
因此抗生素在作用於病菌的同時也會對線粒體產生影響。 對病菌有效的青黴素、真核生物用的抗生素、環孢子菌素（免疫抑制劑）、放線酮等抗生素在另一方面會妨礙所有的線粒體的機能。
簡單地說， 抗生素進入體內會導致線粒體的蛋白合成系統產生故障， 使其不能正常工作， 進而阻礙線粒體生產能量物質ATP 的功能。 我聽說曾有病人因抗生素的毒副作用陷入休克狀態， 這正是抗生素造成大腦細胞中線粒體的機能停止而使人失去意識的實例。 另外， 還曾有病人因服用鏈黴素（以前曾作為治療結核病的處方藥）而出現耳朵失聰的症狀， 我想這可能由於鏈黴素摧毀聽覺細胞的線粒體的緣故。
