臨床上， 胰腺癌容易與胃部疾病、黃疸型肝炎、膽石症、等疾病相混淆， 應注意鑒別。
1、各種慢性胃部疾病
胰腺癌患者與胃部疾病患者都可能出現腹部疼痛症狀， 但後者的腹痛多與飲食有關， 利用X線鋇餐檢查及纖維胃鏡檢查不難作出鑒別。
2、黃疸型肝炎
在初發時二者容易混淆， 但黃疸型肝炎有接觸史， 且動態觀察黃疸初起時血清轉氨酶增高， 黃疸多在2～3周後逐漸消退， 血清鹼性磷酸酶多不高。
3、膽石症、膽囊炎
與胰腺癌相比較， 膽石症與膽囊炎所引起的腹痛呈陣發性絞痛， 急性發作時常有發熱和白細胞增高，
4、原發性肝癌
原發性肝癌患者常有肝炎或肝硬化病史， 血清甲胎蛋白陽性， 先有肝腫大， 黃疸多在後期出現， 且腹痛不因體位改變而變化， 通過超聲和放射性核素掃描可進行鑒別。
5、急慢性胰腺炎
急性胰腺炎患者多有暴飲暴食史， 病情發作急驟， 血白細胞， 血尿澱粉酶升高。 但需要注意的是胰腺深部癌壓迫胰管也可以引起胰腺周圍組織的慢性炎症， 有些患者經各種檢查有時也難鑒別， 此時可在剖腹探查手術中用極細穿刺針作胰腺穿刺活檢以助鑒別。
6、壺腹周圍癌
壺腹周圍癌比胰頭癌少見， 病起多驟然， 也會出現黃疸， 消瘦， 皮癢， 消化道出血等症狀， 而壺腹癌開始為息肉樣突起， 癌本身質地軟而有彈性，
