慢性肝炎的特點就是反復出現肝臟炎症的加重和緩解， 並且會出現多種併發症， 乙肝的併發症最常見的有以下幾種：
1、肝原性糖尿病
乙肝的併發症在臨床表現與Ⅱ型糖尿病相似， 不同點為肝原性糖尿病空腹時胰島素明顯增高而C肽正常。 服糖後胰島素明顯升高而C太峰值仍較正常稍低。 是因為肝臟對胰島素滅活能力減低， 促使胰島素升高， 另外胰高糖素在肝臟滅活減少， 加以肝細胞上胰島素受體減少， 對胰島素產生抗力， 因而雖胰島素升高而血糖仍高， 同時C肽受肝臟影響少， 故C肽不高， 提示β細胞的分泌功能無明顯異常。
2、脂肪肝
機制尚不清， 這類乙肝的併發症特點為一般情況良好， 單項ALT輕、中度升高， 血脂增高， B型超聲檢查可見脂肪肝波形， 確診根據肝活檢病理檢查。
3、肝硬化
慢性肝炎發展為肝硬化， 是肝纖維化的結果。 這類乙肝的併發症是發生機制尚未完全闡明。 尚見於亞急性、慢性重型肝炎及隱匿起病的無症狀HBsAg攜帶者。
4、肝癌
HBV、HCV感染與之發病關係密切。 以慢活肝、肝硬化發生肝癌者多見。 也可見於慢性HBV感染未經肝硬化階段發展為肝癌。 其發生機制目前認為與HBV-DNA整合有關， 尤其是X基因整合。
5、肝性腦病
肝性腦病， 又稱肝昏迷， 或肝腦綜合征， 在乙肝的併發症是肝癌終末期的常見併發症。 以中樞神經系統功能失調和代謝紊亂為特點，
