事實上， 乙肝病毒對肝細胞的破壞， 卻並不存在這種數量關係。 其主要原因就是乙肝病毒並不直接造成肝細胞的破壞， 免疫系統對受感染肝細胞的攻擊才是造成肝細胞損傷的主要原因。 人體的免疫系統是一個統一的整體， 對於外來的抗原十分敏感， 少量的病毒抗原就足以調動起全身的免疫反應， 所以病毒數量的增減與免疫反應的強弱關係並不大。 其實免疫反應的強弱更多的是受自身的調節。 例如人的T淋巴細胞中有一種亞型， 稱為T輔助細胞， 可以增強免疫反應。 還有一種亞型稱為T抑制細胞，
許多實驗資料表明， 血清中HBVDNA的數量（反映血清中的病毒顆粒數量）與反映肝損害嚴重程度的轉氨酶 （ALT、AST）無平行關係， 二者無統計學上的相關性。 肝活檢的組織學檢查也表明， 肝細胞的壞死程度， 肝纖維化的程度與血清中HBVDNA定量水準也沒有相關性。 在臨床上， 我們也觀察到很多患者體內攜帶有大量的乙肝病毒， HBVDNA強陽性， HBeAg陽性， HBsAg滴度也非常高， 但肝功能卻長期正常， 肝組織學也沒有明顯纖維化的跡象。 而很多肝硬化患者常常表現為HBeAg~陰性， HBVDNA陰性， 病毒數量很少， 但肝臟病變卻已達晚期。
