多囊卵巢綜合征由於不排卵所以會引起不孕。 很多因素可以引起持續不排卵。 如中樞神經系統、下丘腦、垂體、腎上腺和卵巢本身功能異常都可引起多囊卵巢。 由於它是一種功能異常, 因此有自然恢復的可能。 需要注意的是多囊卵巢綜合征所表現出來的症狀跟臨床上許多疾病相似易混淆, 因此, 醫生在診斷之前要排除其他疾病, 及時治療多囊卵巢引起的症狀, 不可等閒視之。
由於不排卵引起的不孕可以用克羅米芬或促性腺激素誘發排卵, 如治療得當, 生育力幾乎可以與正常人無異。 對月經稀發或閉經患者如需要妊娠也可誘發排卵治療。