急性精囊炎抗菌治療非常重要， 一般無需止血治療。 但由於前列腺體表面有一層脂質類的包膜， 許多抗生素很難通過此膜而滲透到腺體內而達到治療作用。 常用的藥物有：
紅黴素
紅黴素有較強的穿透性， 對前列腺上皮的滲透作用強。 在酸性環境中可離解為非溶狀態， 對金葡菌、鏈球菌均高度敏感， 對革蘭氏陰性桿菌無效。 因此常與卡那黴素聯合應用。 用法：紅黴素0.25g， 每日4次;卡那黴素0.5g， 每日2次， 肌肉注射， 共用10～14天為第一個療程， 症狀好轉後改為複方新諾明口服， 每次2片， 每日2次， 服10～14天。
複方新諾明
複方新諾明的用藥為2片，
先鋒黴素類藥和三甲氧苄氨嘧啶
可以通過血液進入前列腺體內達到抗炎殺菌作用。 常用的有頭孢拉定膠囊， 口服每次500mg， 每日4次。 嚴重者可每日4～8g， 分2次靜注， 但應注意對頭孢菌素過敏史者禁用， 對青黴素過敏者慎用。 三甲氧苄氨嘧啶的用法多為複方製劑， 與磺胺同用， 複方三甲氧苄氨嘧啶即複方新諾明。
喹諾酮類
近些年來抗菌藥發展很快， 用於急性前列腺炎的抗炎治療藥也增加很多， 喹諾酮類藥用法有氟呱酸0.2g， 每日3次口服;奧複星0.2g， 口服， 每日2次;病情嚴重時可靜脈點滴奧複星， 每次0.2g， 每日2次， 療程10～15天。 不良反應為消化道症狀， 偶見穀丙轉氨酶升高。
青黴素類
有些青黴素類藥物對尿路的特異性細菌有效。 對於非特異性細菌感染引起的效果不理想， 一般情況下不作為首選。
