（一）急性菌痢的治療
1.一般療法和對症療法：病人應予胃腸道隔離（至症狀消失， 大便培養連續二次陰性為止）和臥床休息。 飲食一般以流質或半流質為宜， 忌食多渣多油或有刺激性的食物。 恢復期中可按具體情況逐漸恢復正常飲食。 有失水現象者可給予口服補液鹽。 如有嘔吐等而不能由口攝入時， 則可給予生理鹽水或5%葡萄糖鹽水靜脈滴注， 注射量視失水程度而定， 以保持水和電解質平衡。 有酸中毒者， 酌情給予鹼性液體。 對痙攣性腹痛可給予阿托品及腹部熱敷， 忌用顯著抑制腸蠕動的藥物，
2.病原治療：近年來痢疾桿菌的耐藥菌株， 尤其是多重耐藥菌株漸見增多， 糞便培養檢得致病菌時需作藥敏試驗， 以指導合理用藥。
⑴磺胺類藥：磺胺藥對痢疾桿菌有抗菌活性， 但如與甲氧苄氨嘧啶（TMP）合用，
⑵喹諾酮類：該類藥物作用於細菌DNA促旋酶， 具殺菌作用， 無毒副作用， 已成為成人菌痢的首選藥。 由於該類藥可影響兒童骨骼發育， 學齡前兒童忌用。 成人用法如下：吡呱酸每日2g， 分3次口服， 療程5～7天；諾氟沙星每日600～800mg， 分2～3次口服， 療程同上；依諾沙星、氧氟沙星和環丙沙星每日皆為600mg， 分2次口服， 療程3～5天。
⑶抗生素：儘量口服給藥。 氯黴素、四環素族等抗痢疾桿菌活性差， 耐藥菌株日趨增多， 因而在廣泛應用抗生素的某些大城市中，
慶大黴素的劑量為160～240mg/d， 分2次肌注， 小兒每日3～5mg/kg， 分2次肌注；卡那黴素的劑量為1～1.5g/d， 小兒為每日20～30mg/kg， 分2次給藥；氨苄西林的劑量為2～6g/d， 小兒為每日50～100mg/kg， 分4次給藥。 療程均為5～7天。 必要時， 可加用TMP0.1g， 每日2次， 以增加療效。 近年來， 耐慶大黴素和氨苄西林菌株增加， 有人改用阿米卡星成人每日15mg/kg， 兒童100mg/kg治療菌痢， 取得較好療效， 但多數作者認為， 該藥不宜作為“一線藥物”， 以免耐藥菌株增加。
⑷中藥：黃連素0.3～0.4g， 每日4次；一見喜4g， 每日4次。 療程均為7天。
（二）中毒性菌痢的治療：本型來勢迅猛， 應及時針對病情採取綜合性措施搶救。
1.抗菌治療 採用慶大黴素或阿米卡星與氨苄西林靜脈注射， 劑量、用法同急性期， 中毒症狀好轉後， 按一般急性菌痢治療或改用複方磺胺甲噁唑（SMZ-TMP）或諾氟沙星口服， 總療程7～10天。 氟喹諾酮類靜脈針劑和頭孢呱酮也可使用。
2.高熱和驚厥的治療 高熱易引起驚厥而加重腦缺氧和腦水腫， 應用安乃近及物理降溫， 無效或伴躁動不安、反復驚厥或驚跳者， 可給予亞冬眠療法， 以氯丙嗪與異丙嗪各1～2mg/kg肌注， 必要時靜脈滴注， 病情穩定後延長至2～6小時注射一次， 一般5～7次即可撤除， 儘快使體溫保持在37℃左右。 冬眠靈具有安定中樞神經系統和降溫的作用， 可降低組織耗氧量， 抑制血管運動中樞， 可使小動脈和小靜脈擴張，
3.迴圈衰竭的處理
⑴擴充血容量：因有效迴圈血量減少， 應予補充血容量， 可快速靜脈輸入低分子右旋糖酐或葡萄糖氯化鈉溶液， 首劑10～20ml/kg， 全日總液量50～100ml/kg， 具體視患者病情及尿量而定。 若有酸中毒， 可給5%碳酸氫鈉滴入（詳見“感染性休克”章節）。
⑵血管活性藥物的應用：針對微血管痙攣應用血管擴張劑， 採用山莨菪堿， 成人劑量為10～20mg/次， 兒童每次0.3～0.5mg/kg， 或阿托品成人1～2mg/次， 兒童每次0.03～0.05mg/kg， 注射間隔和次數視病情輕重和症狀緩急而定， 輕症每隔30～60分鐘肌注或靜脈注射一次；重症每隔10～20分鐘靜脈注射一次， 待面色紅潤、迴圈呼吸好轉、四肢溫暖、血壓回升即可停藥， 一般用3～6次即可奏效。如上述方法治療後周圍迴圈不見好轉，可考慮以多巴胺與阿拉明聯合應用。
⑶強心治療：有左心衰和肺水腫者，應給予西地蘭等治療。
⑷抗凝治療：有DIC者採用肝素抗凝療法，劑量及療程同感染性休克。
⑸腎上腺皮質激素的應用：氫化可的松每日5～10mg/kg靜脈滴注，可減輕中毒症狀、降低周圍血管阻力、加強心肌收縮、減輕腦水腫、保護細胞和改善代謝，成人200～500mg/日，一般用藥3～5天。
4.治療呼吸衰竭：應保持呼吸道通暢、給氧、脫水療法（如應用甘露醇或山梨醇）、嚴格控制入液量。必要時給予山梗菜堿、尼可刹米等肌注或靜注。重危病例應給予呼吸監護，氣管插管或應用人工呼吸器。
5.糾正水與電解質紊亂：應補充失液量及鉀、鈉離子，但需慎防用量過大速度過快而引起肺水腫、腦水腫。
（三）慢性菌痢的治療：需長期、系統治療。應盡可能地多次進行大便培養及細菌藥敏試驗，必要時進行乙狀結腸鏡檢查，作為選用藥物及衡量療效的參考。
1. 抗生素的應用：首先要抓緊致病菌的分離鑒定和藥敏檢測，致病菌不敏感或過去曾用的無效藥物暫不宜採用。大多主張聯合應用兩種不同類的抗菌藥物，劑量充足，療程須較長且需重複1～3療程。可供選用藥物同急性菌痢。
2.菌苗治療：應用自身菌苗或混合菌苗，隔日皮下注射一次，劑量自每日0.25ml開始，逐漸增至2.5ml，20天為一療程。菌苗注入後可引起全身性反應，並導致局部充血，促進局部血流，增強白細胞吞噬作用，也可使抗生素易於進入病變部位而發揮效能。此外，也可試以噬菌體治療。
3.局部灌腸療法：使較高濃度的藥物直接作用於病變部位，以增強殺菌作用，並刺激肉芽組織新生，一般作保留灌腸。常用的藥物為5%大蒜浸液100ml或0.5%～1%新黴素100～200ml，每日1次，10～15次為一療程。有人主張灌腸溶液中加入0.25%普魯卡因、氫化可的松25mg，或可提高療效。
4.腸道紊亂的處理：可酌情用鎮靜、解痙或收斂劑。長期抗生素治療後腸道紊亂，可給乳酶生或小劑量異丙嗪、複方苯乙呱啶或針刺足三裡。也可以0.25%普魯卡因液100～200ml保留灌腸，每晚1次，療程10～14天。
5.腸道菌群失調的處理：限制乳類和豆製品。大腸桿菌數量減少者可給乳糖和Vitc，腸球菌減少者可給葉酸。可服乳酶生（含厭氧乳桿菌）4～6g，或枯草桿菌片劑（每片含菌50億），或枯草桿菌溶液100～200ml（每ml含活菌3億）灌腸，每晚1次，療程2～3周，以促使厭氧菌生長，重新恢復腸道菌群平衡。培菲康和麗珠腸樂也可調整腸道菌群，前者成人3～5粒/次，後者2粒/次，皆每天2～3次。
慢性菌痢的治療效果尚欠滿意，如有顯著症狀而大便培養陽性，則需隔離治療。此外，應追查促使轉為慢性的誘因，例如是否有寄生蟲病、胃炎等加雜症，對有關伴發病進行適當的治療，鑒於慢性菌痢病程較長，其急性症狀常有自然緩解傾向，因此，必須反復進行大便培養，才能判斷治療效果。
一般用3～6次即可奏效。如上述方法治療後周圍迴圈不見好轉，可考慮以多巴胺與阿拉明聯合應用。
⑶強心治療：有左心衰和肺水腫者，應給予西地蘭等治療。
⑷抗凝治療：有DIC者採用肝素抗凝療法，劑量及療程同感染性休克。
⑸腎上腺皮質激素的應用：氫化可的松每日5～10mg/kg靜脈滴注，可減輕中毒症狀、降低周圍血管阻力、加強心肌收縮、減輕腦水腫、保護細胞和改善代謝，成人200～500mg/日，一般用藥3～5天。
4.治療呼吸衰竭：應保持呼吸道通暢、給氧、脫水療法（如應用甘露醇或山梨醇）、嚴格控制入液量。必要時給予山梗菜堿、尼可刹米等肌注或靜注。重危病例應給予呼吸監護，氣管插管或應用人工呼吸器。
5.糾正水與電解質紊亂：應補充失液量及鉀、鈉離子，但需慎防用量過大速度過快而引起肺水腫、腦水腫。
（三）慢性菌痢的治療：需長期、系統治療。應盡可能地多次進行大便培養及細菌藥敏試驗，必要時進行乙狀結腸鏡檢查，作為選用藥物及衡量療效的參考。
1. 抗生素的應用：首先要抓緊致病菌的分離鑒定和藥敏檢測，致病菌不敏感或過去曾用的無效藥物暫不宜採用。大多主張聯合應用兩種不同類的抗菌藥物，劑量充足，療程須較長且需重複1～3療程。可供選用藥物同急性菌痢。
2.菌苗治療：應用自身菌苗或混合菌苗，隔日皮下注射一次，劑量自每日0.25ml開始，逐漸增至2.5ml，20天為一療程。菌苗注入後可引起全身性反應，並導致局部充血，促進局部血流，增強白細胞吞噬作用，也可使抗生素易於進入病變部位而發揮效能。此外，也可試以噬菌體治療。
3.局部灌腸療法：使較高濃度的藥物直接作用於病變部位，以增強殺菌作用，並刺激肉芽組織新生，一般作保留灌腸。常用的藥物為5%大蒜浸液100ml或0.5%～1%新黴素100～200ml，每日1次，10～15次為一療程。有人主張灌腸溶液中加入0.25%普魯卡因、氫化可的松25mg，或可提高療效。
4.腸道紊亂的處理：可酌情用鎮靜、解痙或收斂劑。長期抗生素治療後腸道紊亂，可給乳酶生或小劑量異丙嗪、複方苯乙呱啶或針刺足三裡。也可以0.25%普魯卡因液100～200ml保留灌腸，每晚1次，療程10～14天。
5.腸道菌群失調的處理：限制乳類和豆製品。大腸桿菌數量減少者可給乳糖和Vitc，腸球菌減少者可給葉酸。可服乳酶生（含厭氧乳桿菌）4～6g，或枯草桿菌片劑（每片含菌50億），或枯草桿菌溶液100～200ml（每ml含活菌3億）灌腸，每晚1次，療程2～3周，以促使厭氧菌生長，重新恢復腸道菌群平衡。培菲康和麗珠腸樂也可調整腸道菌群，前者成人3～5粒/次，後者2粒/次，皆每天2～3次。
慢性菌痢的治療效果尚欠滿意，如有顯著症狀而大便培養陽性，則需隔離治療。此外，應追查促使轉為慢性的誘因，例如是否有寄生蟲病、胃炎等加雜症，對有關伴發病進行適當的治療，鑒於慢性菌痢病程較長，其急性症狀常有自然緩解傾向，因此，必須反復進行大便培養，才能判斷治療效果。
