大多數學者認為, 病因學對預後的意義有限, 認為病因明確或不明確與預後之間無明顯關係。
(1)腦腫瘤 由腦腫瘤引起的癲癇, 其預後取決於腫瘤的性質、部位、大小及能否根治等因素;另一方面, 即使腫瘤被根除, 但由於手術遺留的疤痕仍可成為致癇灶。 近幾年隨著腫瘤外科治療水準的提高, 其預後也有明顯的改善。 有學者隨訪了115例腦瘤合併癲癇並經手術治療的病人, 癲癇發作完全控制者占31%;26%的病人只是在術後第1年內曾有幾次癲癇發作, 以後很少發作, 同時有腫瘤復發;16%的病人癲癇發作無改善。
(2)腦血管病 老年性癲癇患者, 其主要病因為腦血管病(如腦動脈硬化、腦出血、腦梗死等), 少數腦瘤或腦轉移瘤所致。 有關腦血管病引起的癲癇的預後問題, 長期隨訪報導較少。 有人認為腦血管病引起癲癇發病率較低, 預後較差, 約60%的患者可以完全緩解, 且復發率較低。 但是有人報導, 腦血管病, 特別是天幕上腦梗死的急性期限生癲癇者預後不良, 癲癇復發率高達60%。 腦梗死急性期有癲癇發作者, 其死亡率為30%。
(3)外傷性癲癇 有關外傷性癲癇的緩解率, 各家報導不一致。
(4)腦炎 腦炎的急性期常伴有不同程度的癲癇發作, 部分腦炎病人痊癒後也可出現癲癇發作。 一般病人服用抗癲癇藥物均可控制發作, 預後比較好。 有人報導, 腦炎和腦膜炎伴發癲癇的患者, 腦炎或腦膜炎痊癒後53.3%的病人癲癇發作可完全緩解, 但嚴重腦炎後遺症伴有頻繁癲癇發作者預後不理想。
(5)腦囊蟲病 腦囊蟲病是成人癲癇的常見原因之一, 50%-70%的腦囊病人有癲癇發作。 國外有學者在1992年對153例病人進行6個月至5年(平均28±6個月)的隨訪,
(6)其他病變 由於分娩時或出生後因素致病者, 即伴有器質性腦損傷, 如腦出血、先天性腦發育不全、大腦性癱瘓及精神缺陷等, 其預後不良。 某些先天性疾病, 如結節性硬化症、腦三叉血管瘤病、神經纖維瘤病等,
顱外病因引起的癲癇, 其預後與原發病有關。 如酒精中毒併發癲癇, 若中毒狀態和癲癇均得到充分治療, 其預後良好;胰島細胞腺瘤被有效地切除, 低血糖狀態被糾正, 其預後也好;作為慢性腎病中尿毒癥的併發症, 相應的預後不良。