功能性消化不良是一組以反復發作的餐後飽脹、早飽、厭食、噯氣、噁心、嘔吐、上腹痛、上腹燒灼感或反酸為主要表現而經各項檢查排除器質性、系統性或代謝性疾病的一組常見臨床症候群。 消化不良嚴重影響了人們的生活品質， 那麼如何治療才能夠降低疾病對生命的影響呢?
1、一般治療：説明患兒的家長認識、理解病情， 指導其改善患兒生活方式， 調整飲食結構和習慣， 去除與症狀相關的可能發病因素， 提高緩解症狀的能力。
2、藥物治療：一般療程2—4周。 治療無效者可適當延長療程， 並可進一步檢查，
促動力藥。 多巴胺受體拮抗劑：多潘立酮是能增加胃竇和十二指腸動力， 促進胃排空， 明顯改善FD患兒餐後飽脹、早飽等症狀。 5羥色胺4受體激動劑：枸櫞酸莫沙必利， 可明顯改善FD患者早飽、腹脹。
抗酸及抑酸藥。 常用的抗酸劑有鋁碳酸鎂、複方氫氧化鋁等， 可以緩解症狀。 抑酸藥包括H2受體拮抗劑， 如：西米替丁;和質子泵抑制劑， 如：奧美拉唑。
根除Hp感染。 雖然Hp與FD的發病和症狀間的關係尚不確定， 臨床上對於伴Hp感染的FD患兒仍建議進行根除Hp的治療。
3、精神心理調整：醫生應該具備足夠的同情心、耐心。 給予一定的行為治療、認知治療或心理干預， 可以配合使用一些安慰劑， 大部分症狀會隨著時間的推移而改善。
