肛瘺大多數是肛周膿腫的後遺症。 其主要表現為肛門周圍的外瘺口不斷地有少量膿性分泌物排出， 刺激周圍皮膚， 引起瘙癢不適。 當外口阻塞或假性癒合， 瘺管內膿性液體不能排出， 即形成膿腫。 此時可出現直腸肛管周圍膿腫的症狀， 並有不同程度的局部紅腫、疼痛、發熱、全身乏力。 膿腫自行破潰或切開引流後， 症狀才慢慢消失。 這種由於引流不暢形成的膿腫， 往往是“疼痛--流膿--緩解”反復出現， 這是肛瘺臨床表現的特點。 肛瘺的內口不消除， 便會反復發作， 久治不愈， 因此肛瘺的治療關鍵在於準確找到內口。
雖然， 從大量的臨床資料來看， 多數肛瘺是不會癌變的。 但不可否認， 仍有少數肛瘺病人可發展為惡性病變， 特別是近年來， 有關肛瘺10年以上惡變為癌的報導逐年增多。
肛瘺導致癌變的原因， 大致有以下3個方面：
①長期的慢性炎症刺激。 炎症的長期存在， 使得膿性分泌物及糞便從瘺管排出， 從而刺激組織細胞異常增生， 導致惡性病變。
②細菌感染。 細菌長期存在于瘺管內， 特別是綠膿桿菌或結核桿菌感染， 可纏綿不愈， 從而導致癌變。
③藥物刺激。 長期、大量使用各種局部外用藥， 經常刺激局部， 導致癌變。
