大多數十二指腸潰瘍患者的胃酸分泌是增多的，
該病的主要發病機制是侵襲因素增強，
因此抑酸藥物不可或缺；但以保護胃黏膜為主要作用的藥物對此療效則大打折扣，
如服用硫糖鋁對十二指腸潰瘍的治療幾乎無任何作用。
胃潰瘍患者的胃酸分泌可以正常或低下，
主要發病機制是防禦、修復功能減弱，
此時的抑酸治療並不是最主要的措施，
尤其是對胃酸分泌低下者反而有害。
此時應以保護胃黏膜為主要措施，
如服用硫糖鋁、枸櫞酸鉍鉀、米索前列醇等。
配合適當的飲食治療，
戒煙戒酒、少食辛辣。
十二指腸潰瘍患者的迷走神經功能呈亢奮狀態， 胃酸分泌增加， 此時應用促胃腸動力藥， 不僅於病無益， 反而使大量食物快速進入十二指腸， 刺激十二指腸大量分泌胃泌素， 造成胃酸大量增加， 使原本單純的十二指腸潰瘍又併發胃潰瘍， 成了複合性潰瘍， 更增加了治療難度。
胃潰瘍患者的迷走神經功能正常或低下， 造成胃蠕動減慢， 蠕動力減弱， 此時應用多潘力酮、甲氧氯普胺增加胃動力， 將食物、胃酸和各種消化酶從胃內及時送出， 以儘量減少對胃黏膜的侵蝕。
如何治療兩種潰瘍
當某一患者確診為消化性潰瘍後， 不要急於將三聯或四聯療法不加選擇地應用， 而應進一步細化為胃潰瘍或十二指腸潰瘍。
