一些軀體疾病， 特別是慢性中樞神經系統疾病或其他慢性軀體疾病可成為抑鬱症發生的重要危險因素。 常見的與抑鬱症發生相關的軀體疾病有以下一些。
惡性腫瘤
惡性腫瘤的患者中抑鬱症的發生率明顯高於一般人群， 其原因是多方面的。 惡性腫瘤對患者的健康和生命所構成的威脅以及患病以後對患者生活品質和社會功能的影響、抗腫瘤藥物的不良反應、手術治療所致的軀體殘缺或生活的不便等均可以作為抑鬱症的重要誘因。
代謝性疾病和內分泌疾病
（1）甲狀腺疾病：甲狀腺功能減退（甲減）患者可出現心境低落、思維遲緩、動作緩慢、記憶力下降、注意力不集中、精神萎靡不振、食欲下降、興趣下降或缺乏、嗜睡等症狀，
（2）糖尿病：糖尿病最常見的精神症狀是心境低落， 且糖尿病患者人群的自殺或自殺未遂的發生率是一般人群的3倍， 因此糖尿病是抑鬱症發生的重要危險因素之一。
心血管疾病
冠狀動脈粥樣硬化性心臟病和風濕性心臟病均可作為產生抑鬱症的危險因素。 部分患者可表現出情緒低落、注意力不集中、記憶力下降、睡眠障礙等；還有的患者可出現疑病觀念等。 同時， 抑鬱情緒又會對冠心病的發生發展產生負性影響，
神經系統疾病
帕金森病、癲癇等疾病均容易伴發抑鬱。 調查表明癲癇患者的抑鬱症發生率明顯高於一般人群， 自殺的發生率為一般人群的5倍。 最容易出現抑鬱的癲癇亞型為強直陣攣發作和複雜部分發作。
