便秘的病因是多方面的， 其中主要的有外感寒熱之邪， 內傷飲食情志， 病後體虛， 陰陽氣血不足等。 本病病位在大腸， 並與脾胃肺肝腎密切相關。 脾虛傳送無力， 糟粕內停， 致大腸傳導功能失常， 而成便秘；胃與腸相連， 胃熱熾盛， 下傳大腸， 燔灼津液， 大腸熱盛， 燥屎內結， 可成便秘；肺與大腸相表裡， 肺之燥熱下移大腸， 則大腸傳導功能失常， 而成便秘；肝主疏洩氣機， 若肝氣鬱滯， 則氣滯不行， 腑氣不能暢通；腎主五液而司二便， 若腎陰不足， 則腸道失潤， 若腎陽不足則大腸失于溫煦而傳送無力， 大便不通， 均可導致便秘。
1、腸胃積熱素體陽盛， 或熱病之後， 餘熱留戀， 或肺熱肺燥， 下移大腸， 或過食醇酒厚味， 或過食辛辣， 或過服熱藥， 均可致腸胃積熱， 耗傷津液， 腸道乾澀失潤， 糞質乾燥， 難於排出， 形成所謂“熱秘”。 如《景岳全書·秘結》曰：“陽結證， 必因邪火有餘， 以致津液乾燥。 ”
2、氣機鬱滯憂愁思慮， 脾傷氣結；或抑鬱惱怒， 肝鬱氣滯；或久坐少動， 氣機不利， 均可導致腑氣鬱滯， 通降失常， 傳導失職， 糟粕內停， 不得下行， 或欲便不出， 或出而不暢， 或大便幹結而成氣秘。 如《金匱翼·便秘》曰：“氣秘者， 氣內滯而物不行也。 ”
3、陰寒積滯恣食生冷， 凝滯胃腸；或外感寒邪， 直中腸胃；或過服寒涼， 陰寒內結， 均可導致陰寒內盛， 凝滯胃腸，
4、氣虛陽衰飲食勞倦， 脾胃受損；或素體虛弱， 陽氣不足；或年老體弱， 氣虛陽衰；或久病產後， 正氣未複；或過食生冷， 損傷陽氣；或苦寒攻伐， 傷陽耗氣， 均可導致氣虛陽衰， 氣虛則大腸傳導無力， 陽虛則腸道失于溫煦， 陰寒內結， 便下無力， 使排便時間延長， 形成便秘。 如《景岳全書， 秘結》曰：“凡下焦陽虛， 則陽氣不行， 陽氣不行則不能傳送， 而陰凝於下， 此陽虛而陰結也。 ”
5、陰虧血少素體陰虛；津虧血少；或病後產後， 陰血虛少；或失血奪汗， 傷津亡血；或年高體弱， 陰血虧虛；或過食辛香燥熱， 損耗陰血， 均可導致陰虧血少， 血虛則大腸不榮，
上述各種病因病機之間常常相兼為病， 或互相轉化， 如腸胃積熱與氣機鬱滯可以並見， 陰寒積滯與陽氣虛衰可以相兼；氣機鬱滯日久化熱， 可導致熱結；熱結日久， 耗傷陰津， 又可轉化成陰虛等等。 然而， 便秘總以虛實為綱， 冷秘、熱秘、氣秘屬實， 陰陽氣血不足所致的虛秘則屬虛。 虛實之間可以轉化， 可由虛轉實， 可因虛致實， 而虛實並見。 歸納起來， 形成便秘的基本病機是邪滯大腸， 腑氣閉塞不通或腸失溫潤， 推動無力， 導致大腸傳導功能失常。
