黃連︰味大苦, 性寒而燥。 為苦為火之味, 燥為火之性, 故善入心以清熱, 心中之熱清, 則上焦之熱皆清, 故善治腦膜生炎、腦部充血、時作眩暈、目疾腫疼、肉遮睛(目生雲翳者忌用), 及半身以上赤遊丹毒。 其色純黃, 能入脾胃以除實熱, 使之進食(西人以黃連為健胃藥, 蓋胃有熱則噁心懶食, 西人身體強壯且多肉食, 胃有積熱故宜黃連清之), 更由胃及腸, 治腸下利膿血。 為其性涼而燥, 故治濕熱郁於心下作痞滿(仲景小陷胸湯, 諸瀉心湯皆用之), 女子陰中因濕熱生炎潰爛。
徐靈胎曰︰"苦屬火性宜熱此常理也。 黃連至苦而反至寒,黃連治目之功不必皆內服也。 愚治目睛脹疼者, 俾用黃連淬水, 乘熱屢用棉花瓤蘸擦眼上, 至咽中覺苦乃止, 則脹疼立見輕。 又治目疾紅腫作疼者, 將黃連細末調以芝麻油, 頻頻聞於鼻中, 亦能立見效驗。