病因學尚未完全闡明， 一般認為與周圍環境的有害因素及易感體質有關。 物理的、化學的、生物性的有害因素長期反復作用于易感人體即可引起本病。 病因持續存在或反復發生即可形成慢性病變。
（一）物理因素 長期飲濃茶、烈酒、咖啡， 過熱、過冷、過於粗糙的食物， 可導致胃粘膜的損傷。
（二）化學因素 長期大量服用非甾體類消炎藥如何司匹林、吲哚美辛等可抑制胃粘膜前列腺素的合成， 破壞粘膜屏障；吸煙， 煙草中的尼古丁不僅可影響胃粘膜的血液迴圈， 還可導致幽門括約肌功能紊亂， 造成膽汁反流；各種原因的膽汁反流均可破壞粘膜屏障。
（三）生物因素 細菌尤其是Hp感染， 與慢性胃炎密切相關， 其機理是①Hp呈螺旋形， 具鞭毛結構， 可在粘液層中自由活動， 並與粘膜細胞緊密接觸，
直接侵襲胃粘膜；②產生多種酶及代謝產物如尿素酶及其代謝產物氨， 過氧化物岐化酶、蛋白溶解酶、磷脂酶A等， 可破壞胃粘膜；③細胞毒素（Cytotoxin）可致細胞空泡變性。 ④Hp抗體可造成自身免疫損傷。
（四）免疫因素 慢性萎縮性胃炎患者的血清中能檢出壁細胞抗體（PCA）， 伴有噁心貧血者還能檢出內因數抗體（IFA）。 壁細胞抗原和PCA形成的免疫複體在補體參與下， 破壞壁細胞。 IFA與內因數結合後阻滯維生素B12與內因數結合， 導致惡性貧血。
（五）其他 心力衰竭、肝硬化合併門脈高壓、營養不良都可引起慢性胃炎。
