1、把好水分關
含油類多的藥種水分應控制在8-9%， 一般的藥種水分應控制在12-13%。 如果數量多， 可分期分批進行晾曬， 每隔一段時間翻動1次， 待種子含水量降到安全線以下後再裝缸入庫。
2、把好純度關
藥材良種要單收、單打、單曬、單獨貯存， 確保淨度達到99%以上。 貯存時應貼上標籤， 標明種子名稱、重量、純度、入庫時間等。 要一個容器盛放一個品種。
3、把好存放關
藥種入庫前， 要將庫內雜物清理乾淨， 然後用10%石灰水消毒， 用農藥殺滅害蟲和老鼠。 藥種存放要遠離火爐， 不能存放在廚房裡， 以免煙氣薰蒸。 藥種要放入麻袋、編織袋、布袋內，
4、把好溫度關
藥種不宜曝曬， 同時切忌在水泥地面和鐵板上曬種， 要在傍晚降溫後再入庫。 貯存藥種的溫度最好保持在20℃以下。 散裝種子應在種子中間插放通風草把。 庫內要留出30%的空間， 以利通風換氣。 室外存放的種子， 受凍後不要再轉到暖室內， 暖室內的種子也不要突然移到室外。
5、把好濕度關
藥種應存放在乾燥通風處， 切忌放在封閉、潮濕的倉庫中， 尤其是存放之前， 要在地面上用磚頭或者木頭墊高50釐米以上， 再將盛藥種的容器依次放上， 不能把種袋直接堆放在地面上， 並要遠離牆壁30釐米。 室外存放的種子， 不要讓雨淋濕，
6、把好管理關
貯存期間要定時檢查， 檢查的重點是溫度和濕度。 入庫初期， 每週檢查1次， 中期每10天檢查1次， 後期每20天檢查1次。 發現種子吸潮或溫度過高時， 要及時通風降溫散濕， 如通風仍不能解決問題時， 就必須出庫晾曬至達到安全含水量標準時再入庫。 發現害蟲應立即採取有效防治措施。
