繼發性三叉神經痛：是指由於腫瘤壓迫、炎症、血管畸形引起的三叉神經痛。 常表現為三叉神經麻痹並持續性疼痛， 常合併其他腦神經麻痹， 可由多發性硬化、延髓空洞症、原發性或轉移性顱底腫瘤所致。 做頭部CT和MRI可做出鑒別。
繼發性的三叉神經痛的病因有：①異位動脈或靜脈、動靜脈畸形、動脈瘤對三叉神經根的壓迫、扭轉。 ②橋小腦角或半月節部位的腫瘤， 前者多為膽脂瘤， 聽神經瘤， 腦膜瘤， 其次三叉神經纖維瘤， 頸靜脈孔神經鞘瘤， 血管性腫瘤等；後者如半月神經纖維瘤，
一般牙痛：呈持續性鈍痛， 多局限於牙齦部、進冷、熱食物可加劇， 局部和X線檢查有助鑒別。 醫界流傳“全美國一年有一萬顆牙齒， 因三叉神經痛被誤診而拔除”的說法， 說明醫生常把三叉神經痛誤診為牙痛。 三叉神經從腦內延伸出來後分成三支， 第一支管理一側額部、眼部區域的感覺， 第二支和第三支分別管理下眼瞼、鼻旁、上下嘴唇以及上下兩排牙齒區域的感覺。 如果哪一支患病， 就會出現相應部位的疼痛， 尤以第二、三支發病最多見， 所以患者往往感覺一側的牙齒劇烈疼痛，
鼻竇炎：為局部持續性鈍痛， 局部有壓痛， 可有發熱、白細胞增多、流膿涕等炎症表現， 鼻腔檢查及X線攝片可確診。
顳頜關節病：主要為咀嚼時疼痛而運動受限， 局部有壓痛。
非典型面痛：發生于憂鬱和神經質的患者， 疼痛模糊不定， 通常為兩側， 情緒是唯一加重痛的因素， 但無觸痛點。
需與其他面部疼痛， 如舌咽神經痛相鑒別。
