許多藥物可影響兒童的食欲。 如治療多動症的利太林、苯丙胺等， 都有明顯的抑制食欲作用;某些營養補品如肥兒靈、雅兒靈等， 其糖、脂肪、蛋白質和維生素含量較高， 長期過量食用， 可使孩子胃口欠佳、消化不良、腹脹、腹瀉等， 從而導致兒童營養不良。
長期服用某些激素類藥， 會使兒童發育遲緩， 可引起骨質疏鬆而發生骨折， 還會使體內蛋白質、脂肪、糖等營養物質代謝紊亂， 抑制蛋白質的合成， 減少組織對葡萄糖的利用和再吸收。
服用氯黴素或磺胺等廣譜抗生素的兒童， 可因抑制腸道正常菌群的生長，
常用的抗結核藥， 如異煙肼， 可減少體內維生素B6的含量， 使兒童易發生周圍神經炎;對氨基水楊酸鈉能阻滯腸道攝取脂肪、維生素B12， 異煙肼與對氨基水楊酸鈉均可妨礙對酸的吸收， 導致兒童運動紅細胞性貧血症。
某些鎮靜藥、鎮痛藥如苯巴比妥、苯妥英、撲癇酮、保泰松、吲哚美辛及糖皮質激素等， 可阻礙維生素D、鈣、磷、維生素K的吸收及利用， 直接影響兒童骨骼的發育， 導致兒童佝僂病。 阿司匹林是兒童的常用藥物， 它可使人體對維生素C的利用率大幅降低，
有的家長給兒童服用過量魚肝油， 會導致兒童腹瀉， 造成吸收不良， 甚至維生素A、維生素D中毒。 兒童大量服用維生素C， 破壞了食物中的維生素B2， 亦可導致運動紅細胞性貧血症。
此外， 兒童常服緩瀉劑可使大量胡蘿蔔素、鈣以及維生素A、維生素D、維生素K等從腸道丟失;常服碳酸氫鈉可干擾鐵的吸收， 引起兒童貧血等缺鐵性疾病;常服青黴胺、乙胺丁醇等藥可導致兒童鋅缺乏;長期應用大劑量慶大黴素以及利尿劑等， 可導致低鎂症。
