鼠疫是古老的流行病， 中醫對其有不同的辨證施治方法。 其中用藥物來預防是平安不染時疫的良法。 清代梁達樵在《辨證求真》指出：“平時用九節石菖蒲二分、銀花蕊六錢， 煎水一盅， 先服三分之一， 將三分之二入蜜糖再服可也。 何以先服再服， 內有法道存焉。 先服菖蒲、銀花， 乃通內竅而辟穢， 又嫌菖蒲過燥， 不能多服， 加入蜜糖再服潤燥解毒。 若三味同服， 又嫌蜜糖膩住穢濁， 不能辟疫， 是以一立法貴乎精。 良方名銀蜜平安飲， 可無疫症傳染也。 ”
另外， 也可平日裡多飲茶水， 多吃葛、薯、豆類食物。 清末黎佩蘭在《時症良方釋疑》中指出：宜多飲茶水，
並且， 他還活用王清任的解毒活血湯， 以此加減治療鼠疫， 強調專病專治， （《彙編》化裁）：連翹3錢， 柴胡2錢， 葛根2錢， 生地5錢， 當歸1錢五分， 赤芍3錢， 桃仁8錢， 紅花5錢， 川朴1錢， 甘草2錢， 蘇木1兩5錢， 石膏1兩， 共12味藥。
另有張錫純之白虎加人參湯， 其中又以山藥代粳米,再加玄參， 治療鼠疫症狀。
生石膏（三兩搗細）知母（八錢）玄參（八錢）生懷山藥（六錢）野台參（五錢）甘草（三錢）共煎湯三茶盅， 分三次溫飲下。
最近有研究顯示：選擇6種常用抗菌中藥， 黃連、苦參、連翹、大黃、生地、知母，
